Крыша — общее название верхней части здания, которая защищает его от атмосферных осадков и других внешних воздействий.
Кровля — верхнее покрытие крыши, которое обеспечивает ее водонепроницаемость и теплоизоляцию.
Таким образом, правильно говорить и писать «кровля крыши».